Metode analize elektrofizioloških signala
Predmet | Status | Broj časova (P+V+L) | Krediti |
Plan nastave | Izborni | 3+1+1 | 6 |
Predavanja i vežbe - Nadica Miljković, kabinet 68, lab. 69 | |||
Lab. vežbe - Sara Živković |
Oglasna tabla se ne koristi. Sva obaveštenja će biti postavljena na sajtu predmeta.
13E054MAS predmet ima za cilj da se teorijska saznanja o obradi biosignala primene u praksi.
13E054MAS - Obaveštenja
26.06.2022. PRIJAVE ZA PROLEĆNU ŠKOLU KLINIČKOG INŽENJERSTVA će biti produžene. Mole se svi zainteresovani da se što pre prijave. Više informacija o prijavi može se naći ovde i na sajtu https://ssic.units.it/?page_id=641.
26.06.2022. ISPIT IZ MAS PREDMETA u julskom ispitnom roku je zakazan i u dogovoru sa studentima održaće se 07.07. sa početkom u 11 časova u laboratoriji 69.
19.02.2022. REZULTATI FEBRUARSKOG ISPITNOG ROKA iz MAS predmeta, nakon uvida u radove, su dostupni ovde.
13E054MAS - Materijali
Udžbenik koji pokriva deo o mernoj nesigurnosti i raspodelama merenih signala, Metode i instrumentacija za električna merenja,
Veštine i saveti za studente:
- Uputstvo kako napisati formalno elektronsko pismo - https://ugr.ue.ucsc.edu/email
- Zašto ne treba koristiti "Hvala unapred" u komunikaciji - https://macademic.org/2011/06/08/never-end-your-email-with-thanks-in-advance/
- Kako primeniti naprednu Google pretragu - https://guides.lib.berkeley.edu/GoogleTips
- Uputstvo za pripremu i držanje prezentacija može se pogledati ovde
Prezentacije i video snimci predavanja:
- Uvodni čas i informacije o predmetu (04.10.2021.)
- Uvodno predavanje o analizi biomedicinskih signala (11.10.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/zOzLJoL7RCI
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/AN3ftwxVSFo
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/sGFktST0r8k
- Predavanje 2 - Biomedicinski podaci (18.10.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/RnyB6t7PqPc
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/nNtR7GUU_dw
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/DRbWXdQBs10
- Predavanje 3 - Generisanje sintetičkog EKG signala (25.10.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/NMMkN_0Y1a8
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/1A6fYLKEhts
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/xaupudKWlOI
- Predavanje 4 - Korekcija bazne linije biomedicinskih signala (01.11.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/PIs0Kdn8aTo
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/_CRPNL1InUQ
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/bvbI2L2LE4w
- Predavanje 5 - Frekvencijska analiza EEG signala (08.11.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/a0wKIoy3H6g
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/A-sVeSJMBSU
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/NXt1s6tGNxA
Dodatni i preporučeni materijal (nije obavezan), a odnosi se na potencijalnu primenu sonifikacije EEG signala i alate:-
Väljamäe, Anastasiia, Tony Steffert, Simon Holland, Xavier Marimon, Rafael Benitez, Sebastian Mealla, Aluizio Oliveira, and Sergio Jordà. "A review of real-time EEG sonification research." (2013): 85-93.
-
Kantan, Prithvi, Erika G. Spaich, and Sofia Dahl. "A Technical Framework for Musical Biofeedback in Stroke Rehabilitation." arXiv preprint arXiv:2012.00323 (2020).
- Alat za sonifikaciju slike (zvuk zalaska Sunca), https://news.mit.edu/2022/sound-sunset-sonification-toolkit-0209
- Predavanje 6 - Analiza signala u vremenskom domenu (15.11.2021.)
- GNU Octave kod za deo slika u predavanju, MAS_06.zip
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/71I5GsrD03A
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/4p7hIOYXAkk
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/e2b8gm4iHKk
- Predavanje 10 - Analiza elektromiografskih signala (22.11.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/WVSmGKt9LSs
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/0Wnem6cBJ8I
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/XWEccOOJ5bI
- Predavanje 7 - Filtriranje signala u vremenskom domenu (29.11.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/uE8zRGcofa8
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/xeMY12o_xug
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/p5Cgx1cpOO8
- Predavanje 8 - Metode za dekteciju QRS kompleksa (06.12.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/pP_BBrz_2gk
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/9_cNXiT4Pyw
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/H0nsNLls23M
- Predavanje 9 - Tehnike za ekstrakciju informacija iz biomedicinskih signala (13.12.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/7rPSFF9sFgA
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/4Ad73iu8OfY
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/PRmbGHhneLM
- Predavanje 11 - Vremensko frekvencijska analiza signala (20.12.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/nEyFFkvug1s
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/eutdgLts1WI
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/l8rl2sB97Wo
- Predavanje 12 - vremensko frekvencijska analiza EEG signala i druge teme u analizi biosignala (27.12.2021.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/Te7F_AT0w2k
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/dnSko2wJJXg
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/l4T8XCPJnaE
- Dodatni materijali u 2020/21. godini
- N. Miljković, "Merenje i analiza električnih potencijala mozga sa ciljem percepcije lica", predavanje održano tokom Nedelje svesti o mozgu u organizaciji Studentske sekcije za neuronauke, 2018.
- N. Miljković, "Biomedicinsko inženjerstvo danas: Čovek-računar interfejs", predavanje održano tokom Nedelje svesti o mozgu u organizaciji Studentske sekcije za neuronauke, 2017.
- Gostujuće predavanje Ljubice Cimeše sa temom master rada odbranjenim na ETH u Cirihu
Osnovne informacije o predmetu:
- Sve materijale studentkinje i studenti će dobiti na vežbama i predavanjima ili preko mejling liste.
- Analiza signala se vrši pretežno u programskom paketu Matlab, ali i u GNU Octave-u i Python-u.
Vežbe i predavanja se sastoje iz dva ciklusa i, između ostalog, obuhvataju sledeće celine:
- Učitavanje EKG signala iz PhysioBank - banke podataka na internetu
- Generisanje sintetičkog EKG signala
- Resemplovanje i korekcija bazne linije biomedicinskih signala
- Razdvajanje EEG frekvencijskih komponenti: Diferencijalna moždana aktivnost leve i desne hemisfere
- Metode analize biomedicinskih signala u vremenskom domenu: Periodičnost signala
- Metode analize biomedicinskih signala u vremenskom domenu: Usrednjavanje signala
- Metode analize biomedicinskih signala u vremenskom domenu: Filtriranje signala
- Metode za detekciju QRS kompleksa EKG signala: Pan-Tompkins metoda (originalni rad je dostupan na: https://www.robots.ox.ac.uk/~gari/teaching/cdt/A3/readings/ECG/Pan+Tompkins.pdf)
- Statističke metode analize biomedicinskih signala u vremenskom domenu: ICA (eng. Independent Component Analysis)
- Vremensko frekvencijska analiza signala primenom spektrograma i wavelet transformacije tj. talasića
13E054MAS - Vežbe
Materijali za vežbe:
- Prezenacija za grafički korisnički interfejs u GUI Octave programskom jeziiku koju je 09.12.2020. održao Nebojša Jovanović je dostupna ovde.
- Zadaci za vežbanje u GNU Octave ili Matlab programskim jezicima sa rešenjima,
Vežbe III ciklusa školske 2019/20:
- MAS1_3: Od školske 2017/18. godine, dodata je nova demo vežba (koja se ne ocenjuje), a koja se odnosi se na programiranje i analizu signala u Python programskom jeziku pod nazivom "Prikaz signala u vremenskom i frekvencijskom domenu i filtriranje signala u Pythonu" studentkinje i studenti mogu pogledati na: MAS3_1.pdf. Takođe, dostupni su i vremenski odbirci signala koji je sniman u laboratoriji 69 na Univerzitetu u Beogradu - Elektrotehničkom fakultetu - elektrokardiografski signal ekg.txt. Rešenje za vežbu MAS3_1 u Python-u je takođe dostupno: primerMASresenje.zip.
- MAS2_3: Od školske 2019/20. godine, dodata je još jedna obavezna vežba koju je pripremio demonstrator Nebojša Jovanović pod nazivom "Analiza biosignala u programskom jeziku Python sa ciljem ocene varijabilnosti srčanog ritma",
. Zadaci su takođe dostupni i na GitHub-u: https://github.com/nebojsa55/python-vezba.
NAPOMENA (29.12.2021.) - Rok za predaju vežbe MAS2_3 je pre ispita. Vežba MAS2_3 se ne ocenjuje, ali je obavezna.
13E054MAS - Rokovi
Rezultate kolokvijuma i ispita studentkinje i studenti dobijaju putem e-mail liste koja se formira na početku semestra.