13E054MAS
13E054MAS - Materijali
Udžbenici na srpskom jeziku, koji se mogu koristiti za MAS predmet:
- Užbenik za MSR predmet, koji pokriva deo o mernoj nesigurnosti i raspodelama merenih signala, Metode i instrumentacija za električna merenja,
- Dodatno, udžbenik za TOBS predmet, koji pokriva analizu biosignala, Analiza biosignala sa praktičnim primerima u programskom jeziku R,
Veštine i saveti za studentkinje i studente:
- Uputstvo kako napisati formalno elektronsko pismo - https://ugr.ue.ucsc.edu/email
- Zašto ne treba koristiti "Hvala unapred" u komunikaciji - https://macademic.org/2011/06/08/never-end-your-email-with-thanks-in-advance/
- Kako primeniti naprednu Google pretragu - https://guides.lib.berkeley.edu/GoogleTips
- Uputstvo za pripremu i držanje prezentacija može se pogledati ovde
Prezentacije iz školske 2024/2025. godine i video snimci sa predavanja iz prethodnih semestara:
- Uvodni čas i informacije o predmetu (29.09.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/zOzLJoL7RCI
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/AN3ftwxVSFo
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/sGFktST0r8k
- Predavanje 2 - Biomedicinski podaci (06.10.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/RnyB6t7PqPc
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/nNtR7GUU_dw
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/DRbWXdQBs10
- Predavanje 3 - Modeliranje EKG signala (13.10.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/NMMkN_0Y1a8
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/1A6fYLKEhts
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/xaupudKWlOI
- NAPOMENA: iako se u praksi koristi termin "sintetički", pravilno je "sintetizovani", odnosno "generisani" ili "simulirani".
- Predavanje 4 - Korekcija bazne linije biomedicinskih signala (17.10.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/PIs0Kdn8aTo
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/_CRPNL1InUQ
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/bvbI2L2LE4w
- Predavanje 5 - Frekvencijska analiza EEG signala (20.10.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/a0wKIoy3H6g
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/A-sVeSJMBSU
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/NXt1s6tGNxA
Dodatni i preporučeni materijal (nije obavezan), a odnosi se na potencijalnu primenu sonifikacije EEG signala i alate:-
Väljamäe, Anastasiia, Tony Steffert, Simon Holland, Xavier Marimon, Rafael Benitez, Sebastian Mealla, Aluizio Oliveira, and Sergio Jordà. "A review of real-time EEG sonification research." (2013): 85-93.
-
Kantan, Prithvi, Erika G. Spaich, and Sofia Dahl. "A Technical Framework for Musical Biofeedback in Stroke Rehabilitation." arXiv preprint arXiv:2012.00323 (2020).
- Alat za sonifikaciju slike (zvuk zalaska Sunca), https://news.mit.edu/2022/sound-sunset-sonification-toolkit-0209
- NAPOMENA: Sonifikacija je uobičajena metoda za biofeedback (biološku povratnu spregu), kliničko ispitivanje mišićne aktivnosti iglenim elektrodama (posebno je značajna za pravilnu postavku elektroda), a predstavlja jedan od najranijih načina analize holter elektrokardiograma koju je u svom radu objavljenom u časopisu Science opisao i dr. Holter 1961. godine. Postoje i druge primene.
- Predavanje 6 - Analiza elektromiografskih signala (25.10.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/WVSmGKt9LSs
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/0Wnem6cBJ8I
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/XWEccOOJ5bI
- Predavanje 7 - Analiza signala u vremenskom domenu (02.11.2024.)
- GNU Octave kod za deo slika u predavanju, MAS_07.zip
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/71I5GsrD03A
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/4p7hIOYXAkk
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/e2b8gm4iHKk
- Predavanje 8 - Filtriranje signala u vremenskom domenu (ažurirano 18.11.2024. u 21:17)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/uE8zRGcofa8
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/xeMY12o_xug
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/p5Cgx1cpOO8
- Predavanje 9 - Metode za detekciju QRS kompleksa (25.11.2024.)
- Reference spominjane na predavanju (originalna referenca za PT algoritam i referenca za algoritam u kome je opisana kombinacija izvoda i kvadriranja za detekciju lokalnih ekstremuma, odnosno sakada):
-
Pan, J., & Tompkins, W. J. (1985). A real-time QRS detection algorithm. IEEE transactions on biomedical engineering, (3), 230-236.
-
Black, J. L. (1984). Eye movement analysis: Reading and moving target pursuit. International journal of bio-medical computing, 15(3), 199-217.
-
- GNU Octave kod za deo slika u predavanju, MAS_09.zip (ažurirano 20.11.2023.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/pP_BBrz_2gk
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/9_cNXiT4Pyw
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/H0nsNLls23M
- Reference spominjane na predavanju (originalna referenca za PT algoritam i referenca za algoritam u kome je opisana kombinacija izvoda i kvadriranja za detekciju lokalnih ekstremuma, odnosno sakada):
- Predavanje 10 - Tehnike za izdvajanje informacija iz biomedicinskih signala (02.12.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/7rPSFF9sFgA
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/4Ad73iu8OfY
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/PRmbGHhneLM
- Predavanje 11 - Vremensko frekvencijska analiza biosignala (20.12.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/nEyFFkvug1s
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/eutdgLts1WI
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/l8rl2sB97Wo
- Predavanje 12 - Vremensko frekvencijska analiza EEG signala i druge teme u analizi biosignala (20.12.2024.)
- YouTube link za čas 1, https://youtu.be/Te7F_AT0w2k
- YouTube link za čas 2, https://youtu.be/dnSko2wJJXg
- YouTube link za čas 3, https://youtu.be/l4T8XCPJnaE
- Dodatni materijali:
- N. Miljković, "Biosignals for assessment of cybersickness", predavanje održano na Elektrotehničkom fakultetu, Univerziteta u Ljubljani, 2019.
- N. Miljković, "Biomedicinsko inženjerstvo: Primena istraživanja u kosmičkoj medicini", predavanje održano tokom BNE 2022 (eng. Brand New Engineers) "Od integrala do inženjera" konferencije u organizaciji Udruženja studenata elektrotehnike – Lokalnog komiteta Beograd, 2022.
- N. Miljković, "Merenje i analiza električnih potencijala mozga sa ciljem percepcije lica", predavanje održano tokom Nedelje svesti o mozgu u organizaciji Studentske sekcije za neuronauke, 2018.
- N. Miljković, "Biomedicinsko inženjerstvo danas: Čovek-računar interfejs", predavanje održano tokom Nedelje svesti o mozgu u organizaciji Studentske sekcije za neuronauke, 2017.
- Gostujuće predavanje Ljubice Cimeše sa temom master rada odbranjenim na ETH u Cirihu
Osnovne informacije o predmetu:
- Sve materijale studentkinje i studenti će dobiti na vežbama i predavanjima ili preko mejling liste.
- Analiza signala se vrši u GNU Octave-u i Python-u. Studenti mogu koristiti i druge programske jezike.
Vežbe i predavanja se sastoje iz dva ciklusa i, između ostalog, obuhvataju sledeće celine:
- Učitavanje EKG signala iz PhysioBank - banke podataka na internetu
- Generisanje sintetičkog EKG signala
- Resemplovanje i korekcija bazne linije biomedicinskih signala
- Razdvajanje EEG frekvencijskih komponenti: Diferencijalna moždana aktivnost leve i desne hemisfere
- Metode analize biomedicinskih signala u vremenskom domenu: Periodičnost signala
- Metode analize biomedicinskih signala u vremenskom domenu: Usrednjavanje signala
- Metode analize biomedicinskih signala u vremenskom domenu: Filtriranje signala
- Metode za detekciju QRS kompleksa EKG signala: Pan-Tompkins metoda (originalni rad je dostupan na: https://www.robots.ox.ac.uk/~gari/teaching/cdt/A3/readings/ECG/Pan+Tompkins.pdf)
- Statističke metode analize biomedicinskih signala u vremenskom domenu: ICA (eng. Independent Component Analysis)
- Vremensko frekvencijska analiza signala primenom spektrograma i wavelet transformacije tj. talasića