Signali i sistemi ETF

Tehnike obrade biomedicinskih signala

Sva obaveštenja se nalaze na sajtu TOBS predmeta.

TOBS - Materijali za predavanja

Zainteresovani studenti/kinje mogu pogledati prezentaciju predmeta ovde (iz školske 2016/17).

Svi materijali dostupni u Zenodo repozitorijumu mogu se naći na https://zenodo.org/communities/tobs/.

Prezentacije sa predavanja:

1. Uvodno predavanje, 
   
2. Osnovni podaci u programskom jeziku R, 
3. Interfejsi u R-u, primeri biomedicinskih signala i nauka o podacima, 
   1. Dodatna literatura za 3. lekciju uključuje dve reference o Nikolaju Bernštajnu:
      1. Biryukova, E., & Sirotkina, I. (2020). Forward to Bernstein: movement complexity as a new frontier. Frontiers in Neuroscience, 14. doi: 10.3389/fnins.2020.00553
      2. Vukobratović, M., & Jovanović, M. (2010). Nikolai Aleksandrovich Bernstein - Pioneer in control and cybernetics. International Journal of Humanoid Robotics, 7(01), 213-222. doi: 10.1142/S0219843610002040
4. Operatori, kontrolne strukture, dplyr paket i studija spavanja, 
5. Srčani puls, funkcije, estetika, dplyr paket i pretraga, 
6. Kontrolne funkcije, debagovanje, profilisanje koda i filtriranje biosignala,
7. Generisanje (pseudo)slučajnih brojeva i sintetičkih biosignala, 
8. Analiza EMG-a i vizuelizacija (I deo), 
9. Vizuelizacija (II deo) i merenje signala u R-u,  50.txt. Za merenje signala u R-u korišćeni su sledeći kodovi: analogReadBezKasnjenja.ino i mer.R.
   1. Dodatna i preporučena prezentacija za nauku o podacima od R. Harter "Getting Credit for Invisible Work"
10. Automatski izveštaji i t-test,  Primer .Rmd dokumenta i automatski .pdf izveštaj, studenti mogu pogledati na: download1 i download2.
11. t-test i Case study analize podataka, Kod koji pruža dodatni uvid u osobine t-testa: ttestKod.R.
12. Shiny veb aplikacije, 
    

DODATNE LEKCIJE:

1. PCA i EMD realizacija u R-u za obradu biosignala. Podaci za prezentaciju: 100.txt, EMG.txt.
2. Topografska analiza, klasterizacija biosignala, standardi za snimanje i ETIKA.

Materijali sa predavanja za školsku 2016/2017 godinu: Handout za predavanja 1-5, studenti mogu preuzeti ovde. Za predavanja 6-10, studenti mogu preuzeti handout ovde. Handout za predavanja 11-14 je dostupan ovde. (U handout-u hyperlink-ovi su neaktivni, ali studenti mogu pogledati kompletnu verziju predavanja skeniranjem QR kodova.)

Dodatni materijali:

1. Predavanje održano tokom R-Ladies sastanka 20. juna 2018,
2. Link sa zanimljivih sadržajem tj. "lažnim" korelacijama: http://www.tylervigen.com/spurious-correlations.
3. Preporučeni primeri dobre i loše prakse u vizuelizaciji podataka su dostupni na https://www.reddit.com/r/dataisbeautiful/ i https://www.reddit.com/r/dataisugly/.
4. Broj R paketa od početka držanja TOBS kursa: https://github.com/NadicaSm/simpleRgraph
5. Prezentacija i kod za uvodni blok: https://github.com/NadicaSm/R-for-Data-Science-Short-Course-2020
6. Primer interaktivnog grafika u zdravstvu: https://live.mojdoktor.gov.rs/
7. Kolekcija materijala/knjiga za programiranje u R-u, https://www.bigbookofr.com/index.html
8. Knjiga H. Wickham Mastering Shiny, https://mastering-shiny.org/index.html
9. Visual Vocabulary, https://ft-interactive.github.io/visual-vocabulary/

TOBS - Obaveštenja

05.10.2021. TOBS PREDMET se drži u letnjem semestru. Za sve informacije, obratiti se predmetnom nastavniku na Ova adresa el. pošte je zaštićena od spambotova. Omogućite JavaScript da biste je videli..

Opširnije: TOBS - Obaveštenja

TOBS - Vežbe

Materijali za vežbe:

1. Uvodna vežba: , skript
2. Osnovni podaci i rad sa fajlovima: , skript
   
3. Ekstrakcija, prikaz podataka i nedostajuće vrednosti: , skript
4. Kontrolne strukture, dplyr paket i studija spavanja: , skript
5. Pisanje funkcija i analiza srčanog pulsa: , skript
6. Kontrolne funkcije, pretprocesiranje biosignala i debagovanje: , puls.txt, skript
7. Sintetički EMG signal: , EMG.csv, skript
8. Linearna regresija i vizuelizacija: , skript
9. Vizuelizacija i merenje biosignala: , EMG.csv, EMG6channelsBicepsCocontraction.csv, skript
10. Automatsko generisanje izveštaja: , EMG signali, vezba10Rezultat.pdf, skript
11. T-test u stroke studiji i studiji spavanja: , skript
12. Kreiranje Shiny veb aplikacije: , EMG signali, skript

DODATNE NAPOMENE:

Za proveru postojećih paketa (pre pokretanja instalacije), studenti/kinje mogu koristiti sledeći kod: if (!require("abd")) install.packages("abd"). Primer koda je dat za "abd" paket sa CRAN-a (eng. The Analysis of Biological Data).

Da bi se dodao novi red u tekstu u .Rmd dokumentu, potrebno je dodati dva znaka razmaka tj. space-a.

DODATNI MATERIJALI: Realizacija MA (eng. Moving Average) filtara u R-u je objašnjena ovde.

TOBS - Projekti

Spisak projekata za školsku 2020/21. godinu je dostupan ovde (postavljeno 15.03.2021).

Uputstvo za pripremu i držanje prezentacija, studenti/kinje mogu pogledati ovde.

Opširnije: TOBS - Projekti