Signali i sistemi ETF

Tehnike obrade biomedicinskih signala

Sva obaveštenja se nalaze na sajtu TOBS predmeta.

TOBS - Materijali za predavanja

PLAN NASTAVE U DOBA KORONE, studentkinje i studenti mogu pogledati ovde. Za online časove koristiće se Skype ili Jitsi platforme.

Zainteresovani studenti/kinje mogu pogledati prezentaciju predmeta ovde.

Predavanje održano tokom R-Ladies sastanka 20. juna 2018,

Link sa zanimljivih sadržajem tj. "lažnim" korelacijama: http://www.tylervigen.com/spurious-correlations.

Broj R paketa od početka držanja TOBS kursa: https://github.com/NadicaSm/simpleRgraph

Prezentacija i kod za uvodni blok: https://github.com/NadicaSm/R-for-Data-Science-Short-Course-2020.

Prezentacije sa predavanja:

1. Uvodno predavanje
   
2. Osnovni podaci i manipulacija podacima u R-u
3. Interfejsi u R-u, primeri biomedicinskih signala i Data Science
4. Operatori, kontrolne strukture, dplyr paket i studija spavanja
5. Srčani puls, funkcije, estetika, dplyr paket i pretraga
6. Kontrolne funkcije, debagovanje, profilisanje koda i filtriranje biosignala
7. Generisanje (pseudo)slučajnih brojeva i sintetičkih biosignala
8. Analiza EMG-a i vizuelizacija (I deo)
9. Vizuelizacija (II deo) i merenje signala u R-u, 50.txt. Za merenje signala u R-u korišćeni su sledeći kodovi: analogReadBezKasnjenja.ino i mer.R.
10. Automatski izveštaji i t-test. Primer .Rmd dokumenta i automatski .pdf izveštaj, studenti mogu pogledati na: download1 i download2.
11. t-test i Case study analize podataka. Kod koji pruža dodatni uvid u osobine t-testa: ttestKod.R.
12. Shiny web aplikacije.
13. PCA i EMD realizacija u R-u za obradu biosignala. Podaci za prezentaciju: 100.txt, EMG.txt.
14. Topografska analiza, klasterizacija biosignala, standardi za snimanje i ETIKA.

Materijali sa predavanja za školsku 2016/2017 godinu: Handout za predavanja 1-5, studenti mogu preuzeti ovde. Za predavanja 6-10, studenti mogu preuzeti handout ovde. Handout za predavanja 11-14 je dostupan ovde. (U handout-u hyperlink-ovi su neaktivni, ali studenti mogu pogledati kompletnu verziju predavanja skeniranjem QR kodova.)

TOBS - Obaveštenja

07.04.2020. OTVORENE SU PRIJAVE ZA VIRTUELNU PROLEĆNU ŠKOLU BCI I NEUROTEHNOLOGIJA! Više informacija o školi koja će se održati od 20. do 24. aprila 2020, studentkinje i studenti mogu pogledati na https://www.gtec.at/spring-school-2020.

22.03.2020. PRVO ONLINE PREDAVANJE održaće se u utorak 24.03.2020. Studentkinje i studenti su dobili detaljna uputstva preko mejling liste kako da se priključe predavanju na kome će biti dogovoren plan rada do kraja semestra (uskoro će biti postavljen i na sajt predmeta). Teme predavanja u utorak će biti generisanje automatskog izveštaja i t-test.

17.03.2020. NOVE INFORMACIJE U VEZI SA NASTAVOM su poslate studentkinjama i studentima preko mejla. Za sva pitanja, mole se studentkinje i studenti da pušu na Ova adresa el. pošte je zaštićena od spambotova. Omogućite JavaScript da biste je videli..

15.03.2020. NASTAVA se usled proglašenja vanrednog stanja otkazuje. Mole se sve studentkinje i studenti da prate dalja obaveštenja na sajtu predmeta i na mejling listi.

03.03.2020. UREĐIVAČKI MARATON VIKIPEDIJE - svi zainteresovani mogu pogledati više informacija na sledećem linku.

01.03.2020. FLEXDASHBOARD I R u Staritu u organizaciji R-Ladies, više iformacija na https://www.meetup.com/rladies-belgrade/events/268923088/.

01.03.2020. PhD POZICIJA U DELFTU - više informacija na https://www.iamexpat.nl/career/jobs-netherlands/delft/research-academic/phd-towards-safe-mobility-all-data-driven-approach.

26.02.2020. RASPORED ČASOVA U dogovoru sa studentkinjama i studentima, predavanja i vežbe će se držati utorkom od 17 časova u laboratoriji 69. Za više informacija, poslati mejl predmetnom nastavniku.

26.02.2020. Otto Bock POZICIJA - više informacija ovde.

18.02.2020. OUTREACHY PRAKSA - više informacija studentkinje i studenti mogu pogledati na https://www.outreachy.org/apply/.

13.02.2020. PRVI BLOK NASTAVE održaće se, u dogovoru sa studentkinjama i studentima, u utorak 25.02.2020 sa početkom u 17 časova u laboratoriji 69.

10.02.2020. UVODNI ČAS je pomeren i održaće se, u dogovoru sa studentkinjama i studentima u 16:30 časova u 68.

06.02.2020. NOVA ŠKOLSKA GODINA počinje u ponedeljak 10. februara 2020. godine. Uvodno predavanje iz TOBS predmeta će se održati, prema zvaničnom rasporedu časova koji je objavljen na studentskim servisima, u sredu 12. februara 2020. godine sa početkom u 13 časova u učionici 55.

17.11.2019. PREDAVANJE NA TEMU H2O R I MAŠINSKO UČENJE dr Erin LeDell će se održati u četvrtak 21.11.2019. u Beogradu u Startitu. Više informacija u sekciji Obaveštenja na http://automatika.etf.rs/sr/obave%C5%A1tenja.

19.10.2019. PREZENTACIJA za rad "Driving activity assessment using accelerometer data", koju je nagrađeni student Nikola Šolaja predstavio na IEEE ERK konferenciji u Portorožu u Sloveniji u septembru 2019. godine, je dostupna na Zenodo repozitorijumu.

02.10.2019. PROJEKAT iz TOBS predmeta na temu realizacije Shiny aplikacije za pretragu medicinske radiološke opreme u Srbiji (koja je rađena van konkurentskog takmičarskog dela) studenta Đurđa Gavrovića je dostupan na Zenodo repozitorijumu, a kod je dostupan na GitHub-u.

Opširnije: TOBS - Obaveštenja

TOBS - Vežbe

Materijali za vežbe:

1. Uvodna vežba: prezentacija, skript
2. Osnovni podaci i rad sa fajlovima: txt_fajl, csv_tabela, prezentacija, skript
   
3. Ekstrakcija, prikaz podataka i nedostajuće vrednosti: primerPodataka.csv, primerPodatakaV.csv, prezentacija, skript
4. Kontrolne strukture, dplyr paket i studija spavanja: prezentacija, skript
5. Pisanje funkcija i analiza srčanog pulsa: prezentacija, skript
6. Kontrolne funkcije, pretprocesiranje biosignala i debagovanje: prezentacija, puls.txt, skript
7. Sintetički EMG signal: EMG.csv, zadaci, skript
8. Vizuelizacija: zadaci
9. Vizuelizacija II i merenje signala: zadaci, EMG.csv, EMG6channelsBicepsCocontraction.csv
10. Automatsko generisanje izveštaja: zadaci, EMG signali, vezba10Rezultat.pdf
11. t-test u stroke studiji i studiji spavanja: zadaci
12. Shiny aplikacija i GUI: zadaci, EMG signali

DODATNE NAPOMENE:

Za proveru postojećih paketa (pre pokretanja instalacije), studenti/kinje mogu koristiti sledeći kod: if (!require("abd")) install.packages("abd"). Primer koda je dat za "abd" paket sa CRAN-a (eng. The Analysis of Biological Data).

Da bi se dodao novi red u tekstu u .Rmd dokumentu, potrebno je dodati dva znaka razmaka tj. space-a.

DODATNI MATERIJALI: Realizacija MA (eng. Moving Average) filtara u R-u je objašnjena ovde.

TOBS - Projekti

*** NOVO *** Objavljen je projekat za 2018/19. školsku godinu i dostupan na: tekst projekta (na srpskom), project assignment (in English).

Uputstvo za pripremu i držanje prezentacija, studenti/kinje mogu pogledati ovde.

Opširnije: TOBS - Projekti