Font Size

SCREEN

Cpanel

Tehnike obrade biomedicinskih signala

Predmet Status Broj časova (P+V+L) Krediti
Plan nastave  Izborni   2+0+2  6
Predavanja - Nadica Miljković, kabinet 68, lab. 69
Vežbe - Nadica Miljković, kabinet 68, lab. 69

Sva obaveštenja se nalaze na sajtu TOBS predmeta.

Rlogo

TOBS - Materijali za predavanja

PLAN NASTAVE U DOBA KORONE, studentkinje i studenti mogu pogledati ovde. Za online časove koristiće se Skype ili Jitsi platforme.

Zainteresovani studenti/kinje mogu pogledati prezentaciju predmeta ovde.

Predavanje održano tokom R-Ladies sastanka 20. juna 2018, zenodo.1335666

Link sa zanimljivih sadržajem tj. "lažnim" korelacijama: http://www.tylervigen.com/spurious-correlations.

Broj R paketa od početka držanja TOBS kursa: https://github.com/NadicaSm/simpleRgraph

Prezentacija i kod za uvodni blok: https://github.com/NadicaSm/R-for-Data-Science-Short-Course-2020.

Prezentacije sa predavanja:

  1. Uvodno predavanje
  2. Osnovni podaci i manipulacija podacima u R-u
  3. Interfejsi u R-u, primeri biomedicinskih signala i Data Science
  4. Operatori, kontrolne strukture, dplyr paket i studija spavanja
  5. Srčani puls, funkcije, estetika, dplyr paket i pretraga
  6. Kontrolne funkcije, debagovanje, profilisanje koda i filtriranje biosignala
  7. Generisanje (pseudo)slučajnih brojeva i sintetičkih biosignala
  8. Analiza EMG-a i vizuelizacija (I deo)
  9. Vizuelizacija (II deo) i merenje signala u R-u, 50.txt. Za merenje signala u R-u korišćeni su sledeći kodovi: analogReadBezKasnjenja.ino i mer.R.
  10. Automatski izveštaji i t-test. Primer .Rmd dokumenta i automatski .pdf izveštaj, studenti mogu pogledati na: download1 i download2.
  11. t-test i Case study analize podataka. Kod koji pruža dodatni uvid u osobine t-testa: ttestKod.R.
  12. Shiny web aplikacije.
  13. PCA i EMD realizacija u R-u za obradu biosignala. Podaci za prezentaciju: 100.txt, EMG.txt.
  14. Topografska analiza, klasterizacija biosignala, standardi za snimanje i ETIKA.

Materijali sa predavanja za školsku 2016/2017 godinu: Handout za predavanja 1-5, studenti mogu preuzeti ovde. Za predavanja 6-10, studenti mogu preuzeti handout ovde. Handout za predavanja 11-14 je dostupan ovde. (U handout-u hyperlink-ovi su neaktivni, ali studenti mogu pogledati kompletnu verziju predavanja skeniranjem QR kodova.)

TOBS - Obaveštenja

07.04.2020. OTVORENE SU PRIJAVE ZA VIRTUELNU PROLEĆNU ŠKOLU BCI I NEUROTEHNOLOGIJA! Više informacija o školi koja će se održati od 20. do 24. aprila 2020, studentkinje i studenti mogu pogledati na https://www.gtec.at/spring-school-2020.

22.03.2020. PRVO ONLINE PREDAVANJE održaće se u utorak 24.03.2020. Studentkinje i studenti su dobili detaljna uputstva preko mejling liste kako da se priključe predavanju na kome će biti dogovoren plan rada do kraja semestra (uskoro će biti postavljen i na sajt predmeta). Teme predavanja u utorak će biti generisanje automatskog izveštaja i t-test.

17.03.2020. NOVE INFORMACIJE U VEZI SA NASTAVOM su poslate studentkinjama i studentima preko mejla. Za sva pitanja, mole se studentkinje i studenti da pušu na Ova adresa el. pošte je zaštićena od spambotova. Omogućite JavaScript da biste je videli..

15.03.2020. NASTAVA se usled proglašenja vanrednog stanja otkazuje. Mole se sve studentkinje i studenti da prate dalja obaveštenja na sajtu predmeta i na mejling listi.

03.03.2020. UREĐIVAČKI MARATON VIKIPEDIJE - svi zainteresovani mogu pogledati više informacija na sledećem linku.

01.03.2020. FLEXDASHBOARD I R u Staritu u organizaciji R-Ladies, više iformacija na https://www.meetup.com/rladies-belgrade/events/268923088/.

01.03.2020. PhD POZICIJA U DELFTU - više informacija na https://www.iamexpat.nl/career/jobs-netherlands/delft/research-academic/phd-towards-safe-mobility-all-data-driven-approach.

26.02.2020. RASPORED ČASOVA U dogovoru sa studentkinjama i studentima, predavanja i vežbe će se držati utorkom od 17 časova u laboratoriji 69. Za više informacija, poslati mejl predmetnom nastavniku.

26.02.2020. Otto Bock POZICIJA - više informacija ovde.

18.02.2020. OUTREACHY PRAKSA - više informacija studentkinje i studenti mogu pogledati na https://www.outreachy.org/apply/.

13.02.2020. PRVI BLOK NASTAVE održaće se, u dogovoru sa studentkinjama i studentima, u utorak 25.02.2020 sa početkom u 17 časova u laboratoriji 69.

10.02.2020. UVODNI ČAS je pomeren i održaće se, u dogovoru sa studentkinjama i studentima u 16:30 časova u 68.

06.02.2020. NOVA ŠKOLSKA GODINA počinje u ponedeljak 10. februara 2020. godine. Uvodno predavanje iz TOBS predmeta će se održati, prema zvaničnom rasporedu časova koji je objavljen na studentskim servisima, u sredu 12. februara 2020. godine sa početkom u 13 časova u učionici 55.

17.11.2019. PREDAVANJE NA TEMU H2O R I MAŠINSKO UČENJE dr Erin LeDell će se održati u četvrtak 21.11.2019. u Beogradu u Startitu. Više informacija u sekciji Obaveštenja na http://automatika.etf.rs/sr/obave%C5%A1tenja.

19.10.2019. PREZENTACIJA za rad "Driving activity assessment using accelerometer data", koju je nagrađeni student Nikola Šolaja predstavio na IEEE ERK konferenciji u Portorožu u Sloveniji u septembru 2019. godine, je dostupna na Zenodo repozitorijumu.

IMG 20190924 104915 IMG 20190924 124631 IMG 20190924 113733

02.10.2019. PROJEKAT iz TOBS predmeta na temu realizacije Shiny aplikacije za pretragu medicinske radiološke opreme u Srbiji (koja je rađena van konkurentskog takmičarskog dela) studenta Đurđa Gavrovića je dostupan na Zenodo repozitorijumu, a kod je dostupan na GitHub-u.

Opširnije: TOBS - Obaveštenja

TOBS - Vežbe

Materijali za vežbe:

  1. Uvodna vežba: prezentacija, skript
  2. Osnovni podaci i rad sa fajlovima: txt_fajl, csv_tabela, prezentacija, skript
  3. Ekstrakcija, prikaz podataka i nedostajuće vrednosti: primerPodataka.csv, primerPodatakaV.csv, prezentacija, skript
  4. Kontrolne strukture, dplyr paket i studija spavanja: prezentacija, skript
  5. Pisanje funkcija i analiza srčanog pulsa: prezentacija, skript
  6. Kontrolne funkcije, pretprocesiranje biosignala i debagovanje: prezentacija, puls.txt, skript
  7. Sintetički EMG signal: EMG.csv, zadaci, skript
  8. Vizuelizacija: zadaci
  9. Vizuelizacija II i merenje signala: zadaci, EMG.csv, EMG6channelsBicepsCocontraction.csv
  10. Automatsko generisanje izveštaja: zadaci, EMG signali, vezba10Rezultat.pdf
  11. t-test u stroke studiji i studiji spavanja: zadaci
  12. Shiny aplikacija i GUI: zadaci, EMG signali

DODATNE NAPOMENE:

Za proveru postojećih paketa (pre pokretanja instalacije), studenti/kinje mogu koristiti sledeći kod: if (!require("abd")) install.packages("abd"). Primer koda je dat za "abd" paket sa CRAN-a (eng. The Analysis of Biological Data).

Da bi se dodao novi red u tekstu u .Rmd dokumentu, potrebno je dodati dva znaka razmaka tj. space-a.

DODATNI MATERIJALI: Realizacija MA (eng. Moving Average) filtara u R-u je objašnjena ovde.

TOBS - Projekti

*** NOVO *** Objavljen je projekat za 2018/19. školsku godinu i dostupan na: tekst projekta (na srpskom), project assignment (in English).

Uputstvo za pripremu i držanje prezentacija, studenti/kinje mogu pogledati ovde.

Opširnije: TOBS - Projekti

Potkategorije

Prijavljivanje

Vi ste ovde: Home 13M051TOBS